ما هي أدوار كل عضو في SHD الحفاز الثلاثي؟ كيف تعمل الآلية؟

ما هي أدوار كل عضو في SHD الحفاز الثلاثي؟ كيف تعمل الآلية؟
Anonim

التنمية البشرية المستدامة الثلاثية

ال التنمية البشرية المستدامة ثلاثية الحفز، كما يوحي اسمها ، تتكون من الأحماض الأمينية (AAs) سيرين ، وهيستيدين ، وأسبارتاتي ، التي تكون رموزها المكونة من حرف واحد هي S و H و D على التوالي.

هذا النوع من الثالوث موجود ، على سبيل المثال ، داخل الانزيم التربسين، التي يمكن العثور عليها في البنكرياس ، تم تصنيعها أولا كسلائف غير نشطة (لذلك لا تؤدي وظيفتها إلا إذا دعت الحاجة).

تخفيضات TRYPSIN سندات PEPTIDE محددة

الفكرة في التربسين هي أنه من المفترض أن يتحلل سندات الببتيد المحددة ، حيث تتبع رابطة الببتيد في السؤال # R # مجموعة في تسلسل AA الذي هو كبيرة و # mathbf (("+")) #. هذا مثال على تهمة التكامل.

الرابطة المميزة هي الرابطة الببتيدية التي تتحلل خلال النشاط الأنزيمي عند العثور عليها # R # مجموعة.

دور الأحماض الأمينية

سيرين في هذا ثالوث من شأنه أن يجعل عظيم النيوكليوفيل، إن لم يكن بسبب وجود بروتون. وبعد أن تنكرها من شأنه أن يساعد حقا. لإنجاز هذا ، نحن بحاجة إلى إنجاز شيء ما إلى تأثير خفض pKa من سيرين بحيث تريد التبرع بروتون بعيدا.

الحامض الاميني يصبح حلا مرغوبا فيه المنشط إلى سيرين. نظر ا لأن pKa الهستيدين تبلغ 6.04 تقريب ا ، و pKa serine المحايدة حوالي 15.9 ، فمن غير المحتمل أن يحدث هذا من تلقاء نفسه ، على الرغم من …

ومع ذلك، اسبارتاتي لديه pKa حوالي 3.90 ، وشحنة سالبة ، لذلك كمركب للماء ، فإنه يريد أن يكون حمض بحيث يشكل كل من الهستيدين والأسبارتات تفاعل H- الترابط.

رغبة الأسبرتيت في بروتون الهيستيدين تحث الهيستيدين على ذلك رفع pKa لها للحفاظ على بروتونها العلوي الأيمن ، موازنة بها الفرق pKa بين الهستيدين وسيرين ، وتعزيز deprotonation من سيرين لتشكيل تفاعل H- الترابط.

كمكافأة إضافية ، aspartate أيضا يوجه هيستيدين بحيث يتم الاحتفاظ بجسر الميثيلين ذو الدوران الحر في مكانه. لطيف!

تعمل هذه العناصر مع ا في التربسين ، على سبيل المثال ، لتحفيز التحلل المائي / الانقسام في روابط الببتيد المحددة من البروتينات الأخرى.

ما هي آلية الفكر؟

حسن ا ، هذا مخطط كبير هنا:

  1. الهستيدين يسرق بروتون من سيرين ، وينشطه.
  2. أصبحت سيرين قادرة الآن على مهاجمة كربونيل الكربون ، ملزمة في مجمع رباعي السطوح.
  3. استقر المجمع بواسطة العمود الفقري # "NH" # من جليكاين القريبة ، وكذلك من نفس سيرين. الهستيدين موجه من قبل الأسبارتات. مجمع رباعي السطوح ينهار لتشبث الرابطة الببتيدية والنتيجة # "NH" # يسرق بروتون بعيدا عن الهستيدين.
  4. يمكن أن يستحوذ الهستيدين على بروتون من الماء ، حيث أن pKa لا يزال مرفوع ا (مما يجعله حمض ا أضعف) بعد ثباته بواسطة الأسبارتات.
  5. هيدروكسيد هو نواة كبيرة يمكنها بعد ذلك مهاجمة كربونيل الكربون لهجوم نووي آخر.
  6. مجمع رباعي السطوح ، استقر مرة أخرى من قبل العمود الفقري # "NH" # على الجليسين ونفس السرين ، يمكن بعد ذلك الانهيار ، تشق سيرين على اليمين والاستيلاء على بروتون من الهستيدين كما كان من قبل.
  7. ننتهي مع حمض الكربوكسيل ، نتيجة للتحلل المائي للرابطة الببتيد.